Gènes affectés: TYRP1

Transmission: Autosomique 
Mutation: bc = T>A, Chr11:33317810; bd = 3 bp deletion (del CCT) Chr11:33326727-33326729; bh = G>A, Chr11:33317814 (Husky); bs = C>T, Chr11:33326685

Description:

Les chiens qui possèdent deux copies de l'allèle b produisent des pigments bruns au lieu de noirs dans leurs poils et leur peau. Les chiens porteurs d'une seule copie de l'allèle b produisent des pigments noirs, mais peuvent transmettre l'allèle b à leurs chiots. Les chiens du locus ee porteurs de deux allèles b ont un pelage roux ou crème, mais leur nez, le pourtour de leurs yeux et leurs coussinets sont bruns (on parle parfois de "nez de Dudley" chez les Labrador Retrievers). Le terme "foie" ou "chocolat" est le terme de couleur préféré pour désigner le brun dans la plupart des races ; chez le Doberman Pinscher, on parle de "rouge".

Gènes impliqué: CBD103

Transmission: Autosomique récessive

Mutation: c.231_233del (KB)

Le gène CBD103 noir dominant (locus K) affecte la commutation pigmentaire entre l'eumélanine (noire) et la phaeomélanine (rouge ou jaune) en interagissant avec les gènes Agouti et MC1R

Locus B

(TYRP1) Brun
Gènes affectés: TYRP1

Locus D

(MLPH)Dilution / Dilution de la couleur de la robe
Gènes affectés: MLPH

Locus E
(Extension: Yellow / Red / Lemon)

Gène affecté: MC1R

Transmission: Autosomique récessif

Locus M
Couleur Merle (Gène PMEL)
Gènes affectés: PMEL
Transmission: autosomal dominant

Locus S
(Piebald / panachure blanche)
Transmission: Autosomique dominant
Mutation: c.140_141insA (Panda)

Locus Co (cocoa)
Gènes impliqué: HPS3
Transmission: Autosomique récessive
Mutation: chr23:43969695 (canFam3): G/A

Gènes impliqué: HPS3

Transmission: Autosomique récessive

Mutation: chr23:43969695 (canFam3): G/A

La couleur cocoa chez le Bouledogue français correspond à une teinte brun foncé spécifique causée par une mutation du gène HPS3, distincte du brun « chocolat » classique associé au locus B (TYRP1).

Cette mutation influence la pigmentation du pelage, de la peau et de la truffe, et peut parfois être associée à des yeux vert ou ambre.

Dans le cadre de la couleur cocoa chez le Bouledogue français, une étude récente a montré que le variant responsable (HPS3:c.2420G > A) est fortement associé à la teinte brune du pelage et, bien que ce variant affecte la quantité de granules denses dans les plaquettes, aucune augmentation significative de saignements ou de problèmes de santé n’a été rapportée chez les chiens porteurs homozygotes dans les conditions normales d’élevage ou de vie quotidienne.
- Sources

Gènes affectés : ASIP

Transmission : Autosomique (Ay > aw > at > a)
Mutation : Ay = A>G, Chr24:23393514, T>G, Chr24:23393510; aw/at = 239 bp insertion, Chr24:23365283-23365284; a = C>T, Chr24:23393552

Description:

Les tests génétiques du locus agouti détectent les variants du gène ASIP, soit Ay, aw, at et a. Ils permettent de déterminer si un chien est porteur génétique de l'allèle Ay responsable de la couleur sable ou fauve (Ay/Ay, Ay/aw, Ay/at ou Ay/a), ou de l'allèle aw responsable de la robe "loup"/, sable, grise ou agouti (aw/aw, aw/at ou aw/a). L'allèle at produit le phénotype noir et feu, tricolore ou ¨tan point¨ (at/at ou at/a). L'allèle ¨a¨ ne permet pas l'expression du gène agouti conduisant à un pelage noir uni (a/a).

Ce panel de base sur la couleur du pelage des chiens regroupe plusieurs tests génétiques sur la couleur du pelage applicables à toutes les races.

Locus E - MC1R, (incluant masque mélanistique, grizzle et rouge/jaune Le gène du récepteur de la mélanocortine 1 (MC1R) contrôle la production des pigments eumélanine (noir) et phaeomélanine (rouge/jaune). Six variantes connues de ce gène sont responsables de la production de marques et de couleurs de pelage, notamment le masque mélanique, le grizzle/domino, le noir et les nuances de rouge/jaune.

Locus A- Agouti ASIP
Le gène ASIP interagit avec le gène MC1R pour contrôler les pigments rouges (phaeomélanine) et noirs (eumélanine) chez les chiens, affectant la quantité, le type et la distribution des deux pigments.

Locus B- Brun TYRP1
(Chocolat/Foie)Le gène TYRP1 dilue l'eumélanine (pigment noir) en brun mais n'affecte pas la phaeomélanine (pigment rouge/jaune).

Locus D- Dilution MLPH
(Bleu)Plusieurs variantes de gènes MLPH sont connues pour produire une coloration diluée chez les chiens. Les couleurs sont éclaircies (diluées) et deviennent plus pâles en raison des effets des variantes sur la pigmentation.

Locus K-Noir dominant CBD103 
Le gène CBD103 noir dominant (locus K) affecte la commutation pigmentaire entre l'eumélanine (noire) et la phaeomélanine (rouge ou jaune) en interagissant avec les gènes Agouti et MC1R.

Locus S- Tache pâle/blanche MITF

Les taches blanches qui apparaissent dans de nombreuses races de chiens n'ont pas une base génétique uniforme et la génétique est complexe. Dans le cas de la tache blanche pie/parti/aléatoire, l'étendue de l'expression du motif blanc varie et les marques sont souvent asymétriques.

Locus M- Couleur Merle (Gène PMEL) 
Le pelage de couleur merle se présente avec un patron de taches aléatoires avec des zones de couleur plus foncées ou plus pâles ainsi que des yeux pâles.La couleur merle est transmise de façon dominante signifiant qu'une seule copie est nécessaire pour présenter cette couleur.Une mutation du gène PMEL peut causer des problèmes de santé chez les chiens merle, en particulier les "double merle" et "merle cryptique/ fantôme".

Autres noms: Panachure blanche, Piebald

Transmission: Autosomique dominant

Mutation: c.140_141insA (Panda)

Les taches blanches qui apparaissent dans de nombreuses races de chiens n'ont pas une base génétique uniforme et la génétique est complexe. Dans le cas de la tache blanche pie/parti/aléatoire, l'étendue de l'expression du motif blanc varie et les marques sont souvent asymétriques.

Gènes impliqué: MFSD12

Transmission: Autosomique récessive

Mutation: UU_Cfam_GSD_1.0 chr20 :g.56252402C>T

 le gène MFSD12 impliquée dans la dilution de la phéomélanine conduisant à une couleur de pelage blanche ou crème chez les chiens.

Autres noms: Locus L, L2
En anglais: Long hair/fluffy
Gènes affectés: FGF5
Transmission: autosomal recessif
Mutation: CanFam3.1    32    g.4528639C>T    c.578C>T    p.(A193V)
Lien OMIA:  000439-9615

Races appropriées pour les tests : 
Akita, Samoyed

Description:
Le locus L a un impact sur la longueur des poils canins dû à une mutation dans le gène FGF5 qui empêche FGF5 de fonctionner comme un signal de terminaison de la croissance des poils dans le follicule pileux.

Gènes affectés : PMEL

Transmission : autosomal dominant 

Mutation : 
Insertion d'un SINE à la limite de l'intron 10 et de l'exon 11, flanquée d'une duplication de 15 pb du site cible sur le chromosome 10.

Lien OMIA: 000211-9615

Races appropriées pour les tests : 

Berger australien, Border collie, Léopard catahoula, Teckel, Mudi hongrois, Shetland

Description:

Le pelage de couleur merle se présente avec un patron de taches aléatoires avec des zones de couleur plus foncées ou plus pâles ainsi que des yeux pâles.

La couleur merle est transmise de façon dominante signifiant qu'une seule copie est nécessaire pour présenter cette couleur.

Une mutation du gène PMEL peut causer des problèmes de santé chez les chiens merle, en particulier les "double merle" et "merle cryptique/ fantôme". 
Consultez ce site pour plus de détails: Labgenvet

Bêtagène détermine la mutation responsable, c'est-à-dire une insertion dans le gène PMEL, mais la longueur de cette insertion associée avec les différentes couleurs ou patrons de tache n'est pas déterminée.

Gène affecté: MC1R

Transmission: Autosomique récessif
Mutation: CanFam3.1 5 g.63694433_63694434del c.816_817del  (2pb del CT)  
Lien OMIA: 001590-9615

Races appropriées pour les tests: Berger Australien, Colley à poil long, Colley à poil court, Shetland Sheepdog (Berger des Shetland), Retriever de la Nouvelle-Écosse, Berger Blanc Suisse, Husky Sibérien, Husky d'Alaska, Bouvier Australien.

Autres noms: Locus D dilution, allèle d^1, Colour mutant alopecia; Color dilution alopecia; Colour dilution alopecia

En anglais: Coat colour, dilution, MLPH-related 

Gènes affectés: MLPH

Transmission: Autosomique récessive

Mutation: Allèle d^1: CanFam3.1 (chr25)    g.48121642G>A    c.-22G>A

Lien OMIA:  000031-9615

Races appropriées pour les tests: Berger Australien, Doberman Pinscher, Grand Danois, Staffordshire Bull Terrier, Chien de Saint-Hubert, Chihuahua, Chow-Chow, Carlin (Pug), Dogue de Bordeaux, Épagneul Cocker, Labrador Retriever, Border Collie, Braque Allemand à poil court, Weimaraner, Bichon Frisé, Teckel, Caniche, Whippet, Bulldog Anglais, Shar-Pei, Berger Allemand.

Caractéristiques:
La dilution de la couleur de la robe chez plusieurs races de chiens se caractérise par un phénotype de pigmentation spécifique et s'accompagne parfois d'une perte de poils et d'une inflammation cutanée récurrente, appelée alopécie de dilution de la couleur ou dysplasie folliculaire des poils noirs.

Autres noms: Locus L, L3 et L4
En anglais: Long hair/fluffy
Gènes affectés: FGF5
Transmission: autosomal recessif

Mutation : 
L3 (Eurasier) CanFam3.1    32    g.4528617_4528632del    c.556_571del    p.(A186Tfs*71) Del16
L4 (Bouledog Français, Lévrier Afghan et Eurasier)     CanFam3.1    32    g.4528620_4528621dup    c.559_560dup    p.(R188Afs*75)
Lien OMIA:  000439-9615

Races appropriées pour les tests : Bouledogue Français, Lévrier Afghan et Eurasier 

Description:
Le locus L a un impact sur la longueur des poils canins dû à une mutation dans le gène FGF5 qui empêche FGF5 de fonctionner comme un signal de terminaison de la croissance des poils dans le follicule pileux.

Gène affecté: MC1R
Transmission: Autosomal dominant
Mutation: CanFam3.1   chr5  g.63694460C>T c.790A>G
Lien OMIA:  001590-9615

Races appropriées pour les tests : 
Boxer, Bullmastiff, Boston Terrier, Cairn Terrier, Dogue Allemand, Carlin (Pug), Akita, Mastiff, Berger Belge Malinois, Rhodesian Ridgeback

Autres noms: furnishings, improper coat, poil dur (wire hair trait, wirehaired trait)

En anglais: Improper Coat/Furnishing (RSPO2)
Gènes affectés: RSPO2
Transmission: Autosomal Recessive (Improper Coat); Autosomal Dominant (Furnishing)
Mutation: CanFam3.1 chr13:8610419-8610420: 167 bp insertion
Lien OMIA: 001498-9615

Races appropriées pour les tests
Plusieurs races dont :
Black Russian Terrier,  Chinese Crested,  Havanais, Havanais Terrier, Vizsla, Irish Terrier , Lagotto Romagnolo, Caniches, Chien d'eau portugais, Scottish Terrier , Soft Coated Wheaten Terrier , Terrier Tibétain. 

Description:

Le locus IC (improper coat) pour certaines races (comme le chien d'eau portuguais), présente un chien pouvant un manque de densité au niveau du pelage (furnishing) et possède des poils courts sur la tête, le visage et le bas des jambes, plutôt qu'un pelage épais et uniforme couvrant tout le corps. Chez certaines autres races, le phénotype est souhaitable.

Le génotype du chien dépend aussi d'une combinaison des locus L, Cu et IC

En anglais: Long hair/fluffy
Gènes affectés: FGF5
Transmission: autosomal recessif
Mutation: CanFam3.1    32    g.4509367G>T    c.284G>T
Lien OMIA:  000439-9615

Races appropriées pour les tests: 
Plusieurs races dont: Lévrier Afghan, Border Collie, Cocker Spaniel, Collie, Corgi, Teckel, Berger Allemand, Golden Retriever, Poméranien, Samoyède, Shiba Inu

Description:
Le locus L a un impact sur la longueur des poils canins dû à une mutation dans le gène FGF5 qui empêche FGF5 de fonctionner comme un signal de terminaison de la croissance des poils dans le follicule pileux.

Autres noms: Locus E (Extension : Jaune / Rouge /« Lemon »)

En anglais: E Locus (Extension: Yellow / Red / Lemon)

Gène affecté: MC1R

Transmission: Autosomique récessif
Mutation : 

Red/yellow coat  e^1 CanFam3.1    chr5    g.63,694,334 G>A        c.916C>T    p.(R306*)
Lien OMIA: 001590-9615

Races appropriées pour les tests : 
Plusieurs races, incluant: Retriever du Labrador, Golden Retriever, Épagneul Cocker, Teckel, Boxer, Beagle, Setter Irlandais, Dogue Allemand, Mastiff, Basset Hound, Welsh Corgi (Pembroke et Cardigan), Caniche (Caniche Nain, Caniche Moyen, Caniche Standard), Chihuahua.